Przy kościele św. Marka działa Ośrodek Katechumenalny, powołany do istnienia przez Ks. Kard. Franciszka Macharskiego. Zajmuje się on przygotowaniem osób dorosłych do przyjęcia wiary katolickiej i sakramentów: chrztu, bierzmowania, I spowiedzi i Komunii świętej, spowiedzi po latach. Przygotowujemy też ochrzczonych w innych niż katolicka wspólnotach chrześcijańskich do wejścia w pełnię jedności z Kościołem katolickim.
Rektor kościoła św. Marka Ewangelisty, Ks. Andrzej Wójcik, jest z ramienia Archidiecezji Krakowskiej odpowiedzialny za ten Ośrodek. Koordynatorką zaś ze strony wspólnoty jadwiżanek wawelskich (które z racji swojego charyzmatu posługują w katechumanacie) jest aktualnie s. Marzena Władowska CHR. Grupę anglojęzyczną prowadzi s. Marta Łopion CHR. Więcej informacji znajdziesz na stronie Ośrodek Katechumenalny.